7

Декабрь

Рабочая группа по бешенству, включающая специалистов ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН, представила результаты изучения филодинамики вируса бешенства на территории Российской Федерации

На основание филогенетического анализа 82 штаммов гена N (1 100 н.о.) вируса бешенства (Mononegavirales, Rhabdoviridae, Lyssavirus), изолированных в период 1977-2016 гг. на территории бывшего СССР и Российской Федерации, была проведена реконструкция основных филогенетических событий и проведена датировка появления различных геновариантов вируса бешенства.

Установлено, что "космополитный" степной тип С подразделяются на три филогенетически дискретные подгруппы (С0-С1) с характерной географической локализацией. В работе впервые описана циркуляция вирусов подгруппы А2 (Канада, Аляска, Якутия) на территории севера европейской части России и на Земле Франца-Иосифа. Присутствие геноварианта вируса бешенства степного типа на территории Приморского края может быть результатом антропогенного переноса вируса в середине 1990-х гг., но его циркуляция в регионе подтверждена изоляцией штамма RABV/Ursus arctos/Russia/Primorye/PO‑01/2014 (первого и единственного, на сегодняшний день, штамма вируса бешенства от бурого медведя). Филогенетический анализ показал, что все геноварианты вируса бешенства, встречающиеся в настоящее время на территории Российской Федерации, сформировались в течение нескольких последних столетий и получили широкое распространение в XX веке.

Полученные результаты изложены в научных публикациях:
  1. Щелканов М.Ю., Девяткин А.А., Ананьев В.Ю., Фролов Е.В., Домбровская И.Э., Дедков В.Г., Ардашев А.В., Коломеец С.А., Короткова И.П., Любченко Е.Н., Бандеев В.В., Просянникова М.Н., Галкина И.В., Иванушко Е.С., Емельянова Н.П., Баранов Н.И., Ульянова С.А., Арамилев С.В., Фоменко П.В., Суровый А.Л., Порошин Н.А., Сокол Н.Н., Маслов Д.В., Махиня Е.Е., Шипулин Г.А. Изоляция и секвенирование полноразмерного генома штамма вируса бешенства, изолированного от бурого медведя (Ursus arctos), напавшего на человека в Приморском крае (ноябрь 2014 г.) // Вопросы вирусологии. – 2016. – Т. 61. – № 4. – С. 180–186.
  2. Shchelkanov M.Yu., Deviatkin A.A., Ananiev V.Yu., Dedkov V.G., Shipulin G.A., Sokol N.N., Dombrovskaya I.E., Galkina I.V., Shmelev M.Eu., Gorelikov V.N., Kozhan V.N., Prosyannikova M.N., Aramilev S.V., Fomenko P.V. Complete Genome Sequencing of Rabies Virus Strain isolated from Brown Bear (Ursus arctos) in Primorsky Krai (November, 2014) // Genome Announcements. – 2016. – N 4. – P. e00642-16.
  3. Девяткин А.А., Лукашев А.Н., Полещук Е.М., Ткачёв С.Е., Дедков В.Г., Сидоров Г.Н., Щелканов М.Ю., Галкина И.В., Карганова Г.Г., Гаврило М.В., Шипулин Г.А. Молекулярная эпидемиология вируса бешенства на территории Российской Федерации // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. – 2017. – № 1. – С. 39–42.
  4. Dedkov V.G., Deviatkin A.A., Poleshchuk E.M., Safonova M.V., Blinova E.A., Shchelkanov M.Yu., Sidorov G.N., Simonova E.G., Shipulin G.A. Development and evaluation of a RT-qPCR assay for fast and sensitive rabies diagnostics // Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. – 2017 – P. pii: S0732-8893(17)30283-3.
  5. Deviatkin A.A., Lukashev A.N., Poleshchuk E.M., Dedkov V.G., Tkachev S.E., Sidorov G.N., Karganova G.G., Gavrilo M.V., Galkina I.V., Shchelkanov M.Yu., Shipulin G.A. Molecular Epidemiology of Rabies in the Russian Federation // PLoS ONE. – 2017. – V. 12. – N 2. – P. e0171855.